История разворачивается в 2015 году, во времена последней эпохи, на которую магия всё ещё оказывает большое влияние. Ради наблюдения за миром и выживания человечества была создана организация Халдея. Благодаря усилиям многочисленных исследователей человеческая история была предопределена на 100 лет вперёд. Однако, неожиданно, мир будущего, находящийся под наблюдением Халдеи, исчез. Факт вымирания человечества к 2017 году подтвердился. Причиной исчезновения стал город Фуюки 2004 года. В этом городе обнаружилась "ненаблюдаемая область", которой раньше там не было. Халдея издаёт Великий приказ на "Экспедицию Святого Грааля", которая должна найти, выявить и, по-возможности, уничтожить сингулярность, которая станет причиной вымирания человечества.